基因检测案例分享常染色体显性智力障碍5型

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受检者女性，5岁

无家族史

新生儿体健，1岁6个月会走，2岁会叫爸爸、妈妈。年夏天发热大于39℃，出现惊厥一次。患病至今发音不全，只能发叠音，大小便不能控制，叫名等简单指令可完成，与他人交流欠佳。脑电图结果显示异常脑波，痫性放电。MR结果显示：右侧顶叶、双侧枕叶白质内异常信号，考虑髓鞘发育不良。临床考虑：语言、智力发育迟缓，神经系统病变。

二2.全外显子组报告解读

2.1变异信息展示

经全外显子测序，在SYNGAP1基因的第5号外显子上检测到1个移码突变。SYNGAP1基因位于6号染色体p21.32区带，负责编码RasGTPase激活蛋白。

2.2变异对应疾病

SYNGAP1基因变异与常染色体显性智力障碍5型（Mentalretardation,autosomaldominant5）有关。该病主要特点是中度至重度的智力障碍，在出生后的头几年出现明显的精神运动发育迟缓，大多数患者出现不同类型的癫痫发作，脑电图异常，脑MRI正常（极少数出现脑萎缩或髓鞘化延迟），有的患有自闭症或自闭症谱系障碍，有的患有小头畸形症[1]。该病呈常染色体显性遗传，外显率为%，发病率无明确数值，一项对名癫痫性脑病患者的测序研究显示，SYNGAP1基因变异约占1%[2]，而在另一项名智力障碍儿童的研究中占0.75%[3]。

2.3变异致病性解读

受检者的SYNGAP1基因的第5号外显子上(位置：chr6:33,,)发生了1个移码突变(frameshiftvariant)，c.dupC:p.Argfs，即编码区第号碱基发生重复，导致蛋白自第号氨基酸开始发生移码变异。无人群携带记录（数据来源：0G、ExAC、ESP和GnomAD数据库）。有文献报道1名SYNGAP1基因相关智力障碍和癫痫患者中发现一个致病变异:c.CT:p.Arg*[4]。Sanger测序结果显示受检者携带此变异，父亲、母亲、妹妹均野生型。

依据ACMG指南，判定该变异为致病的变异。

变异分级参考ACMG指南，分级依据为：

PVS1：

当一个疾病的致病机制为功能丧失（LOF）时，无功能变异（无义突变、移码突变、经典±1或2的剪接突变、起始密码子变异、单个或多个外显子缺失）。

PM2：

ESP数据库、千人数据库、EXAC数据库中正常对照人群中未发现的变异（或隐性遗传病中极低频位点）。

PM6：

未经父母样本验证的新发变异。

小结

SYNGAP1基因相关的智力障碍的特征是发育迟缓或智力障碍（%个体受影响）、广泛性癫痫（84%）、自闭症谱系障碍(ASD)和其他行为异常（50%）。迄今为止，已有50多例SYNGAP1基因相关智力障碍患者被报告。

本案例中，受检者携带SYNGAP1基因的一个新发突变。

参考文献

1.Berryer,M.H.,Hamdan,F.F.,Klitten,L.L.,Moller,R.S.,Carmant,L.,Schwartzentruber,J.,Patry,L.,Dobrzeniecka,S.,Rochefort,D.,Neugnot-Cerioli,M.,Lacaille,J.-C.,Niu,Z.,and15others.MutationsinSYNGAP1causeintellectualdisability,autism,andaspecificformofepilepsybyinducinghaploinsufficiency.Hum.Mutat.34:-,.

2.CarvillGL,HeavinSB,YendleSC,McMahonJM,ORoakBJ,CookJ,KhanA,DorschnerMO,WeaverM,CalvertS,MaloneS,WallaceG,StanleyT,ByeAM,BleaselA,HowellKB,KivityS,MackayMT,Rodriguez-CaseroV,WebsterR,KorczynA,AfawiZ,ZelnickN,Lerman-SagieT,LevD,M?llerRS,GillD,AndradeDM,FreemanJL,SadleirLG,ShendureJ,BerkovicSF,SchefferIE,MeffordHC.TargetedresequencinginepilepticencephalopathiesidentifiesdenovomutationsinCHD2andSYNGAP1.NatGenet.;45:–30.

3.FitzgeraldTW,GeretySS,JonesWD,vanKogelenbergM,KingDA,McRaeJ,MorleyKI,ParthibanV,Al-TurkiS,AmbridgeK,BarrettDM,BayzetinovaT,ClaytonS,CoomberEL,GribbleS,JonesP,KrishnappaN,MasonLE,etal.Large-scalediscoveryofnovelgeneticcausesofdevelopmentaldisorders.Nature.;:–8.

4.MignotC,vonStülpnagelC,NavaC,VilleD,SanlavilleD,LescaG,RastetterA,GachetB,MarieY,KorenkeGC,BorggraefeI,Hoffmann-ZacharskaD,SzczepanikE,Rudzka-Dyba?aM,Yi?U,?a?layanH,IsapofA,MareyI,PanagiotakakiE,KorffC,RossierE,RiessA,Beck-WoedlS,RauchA,ZweierC,HoyerJ,ReisA,MironovM,BobylovaM,MukhinK,Hernandez-HernandezL,MaherB,SisodiyaS,KuhnM,GlaeserD,WeckhuysenS,MyersCT,MeffordHC,H?rtnagelK,BiskupS;EuroEPINOMICS-RESMAEworkinggroup,LemkeJR,HéronD,KlugerG,DepienneC.GeneticandneurodevelopmentalspectrumofSYNGAP1-associatedintellectualdisabilityandepilepsy.JMedGenet.Aug;53(8):-22.

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